電腦病毒的觀念最早是由電腦界大師－馮紐曼（Von Neuman）所引發出來的，當時並非用來設計電腦病毒的，數年之後，貝爾實驗室的研究人員利用此觀念設計出磁蕊大戰（Core War）的遊戲。

這個電腦遊戲限制只有兩個人玩，遊戲中他們分別寫一支程式互相比較誰的功力較強，只要誰能把對方的程式吃掉，誰的程式設計即較強。在當時他們研究這理論的動機，僅止於使自己的電腦系統較具有防護的能力而已，並未考慮到去設計成電腦病毒。

但在磁蕊大戰事件發生後，漸漸的有人發展出開玩笑性質的病毒（如兩隻老虎及大榔頭病毒等），其用意只是要讓那些隨便拷貝軟體的使用者能夠有所警惕。接著有人設計出具有覆蓋型的電腦病毒出來（如癌症、512病毒等），藉此使程式無法執行、電腦當機、硬碟格式化等等。

近年來製造電腦病毒的原因已經多元化、流行化，如慶祝某些節日或表達宗教上、政治上的意見，甚至為了顯示自己的能力、滿足自我或挑戰別人等，但此種行為卻造成極大的破壞性，也違反了許多道德觀及引發諸多的法律問題。