實證科學也許一開始就是從錯誤的基點上發展起來的，它起源於人對世界、對人與宇宙關係根本上錯誤的看法，它在物質與精神、人與對宇宙兩個二元對立的哲學世界觀指導下形成了自己的方法論。

這種世界觀首先把一個完整的世界劃分為兩個極端的範疇：物質與精神，認為客觀上有一類現象屬於物質，另一類現象屬於精神。歷史上一直把二者放到對立的位置上非要爭出個誰是第一性，誰決定了誰。何謂「物質」？它是完全排除了精神因素，沒有絲毫靈性，不包括任何生命主體性在內的絕對存在，也叫做純粹的「自然」。這一思想可追溯到古希臘德謨克利特的被動、機械的「原子」，亞里斯多德的「四因說」，到笛卡爾的「二元論」達到了頂峰。人類就置身於這麼一個冰冷的「自然」中生息、繁衍，科學就以這樣的「自然」為研究對象，似乎純粹到這種地步，科學認識的才是客觀真理。那麼，什麼是精神呢？科學對精神所知甚微，揭示精神現象的本質彷彿不在科學的視野之內，那完全是宗教、神學、文學或藝術的事情，科學並不為此巨大缺陷而不安。然而，純粹的「自然」是不存在的。站在能量的角度看，任何物質都是生命，就都與精神特性相聯繫，都有靈性，物質與精神完全是融合的，根本就分不開；失去了一方，另一方和整個事物就不復存在。宇宙中只存在不同能階構成的不同層次，並沒有什麼單獨的物質或思想；當人們硬把物質與精神分離，並完全撇開精神之後，科學就無法證實，也不承認另外空間裏存在的物質和生命現象，也永遠無法解釋精神現象，也就不能昇華到更高的能量層次上去認識生命的本質、事物的本質，而只能與一堆毫無生機的機械性質，一些表面的線性現象打交道了。片面強調這種排斥人的思想境界方面事情的科學，導致了人類道德水準的大滑坡，是當今社會一切不科學、不協調的醜陋現象的根源。這便是實證科學最不完善的地方。

心與物的分離必然帶來人與宇宙的分離。既然「物質」的世界不容摻進任何精神的「雜質」，人這一萬物之靈就得從生育滋養他的宇宙母體中被排斥出去。宇宙成了獨立於心智，不包括人在內，是外部事物的羅列；人成了站在宇宙之外，不受它影響的「觀察者」，被迫只能在這種外在的關係中認識宇宙。可是這又是一種主觀人為的二元對立，是對現實的嚴重歪曲。人原本內在地包含在宇宙當中，和宇宙在各個空間裏發生著息息相通的血脈聯繫。雖然他的存在與否不會影響到宇宙的存在，但他的生存與意識型態卻直接影響到宇宙向他顯現的樣子。量子力學「測不準原理」表明，對粒子的兩個物理量不能同時精確測定；這不是因為我們的測量技術不完善，而是因為我們如何進行測量的方式。這種方式在某種程度上決定了被觀察事物的性質，若換一個觀測或測量的方法，物體向我們顯現的性質也會改變。科學家無法扮演獨立的客觀的「觀察者」角色，而必然要捲入到他所觀察的世界裏去，成為影響到世界性質的「參與者」。其問題就在於「如何在這幕壯觀的戲劇中，使我們既是觀眾又是演員的身份能夠協調起來。」人作為獨立、客觀的「觀察者」身份，使科學走了一條外在的認識路線（認識方式）。由於二元論的謬誤，人類被長久地束縛在低能量物質空間層次裏去研究。

(摘錄自正見網，《新科學展望 - 天人篇 (下)》，2001年1月31日)